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首先告诉你是可以的，我倒没试过把windows的系统做到移动硬盘上用移动硬盘启动，不选择用的原因是和知USB的读取速度还有其稳定性有关，像win PE和Chrome都可以用U盘来启动的。虽然说是可以，但系统这个问题道你最好是找个懂的人来做，设置用移动硬盘来启动并运行系回统不是件容易事。你如果真的想在苹果机上运行windows系统直接可以去苹果店，他们的技术会帮你解决，如果想自己解决，那你还要多学习答学习电脑相关知识才行，并且要承受得住失败。
推荐你使用 ExFAT 格式的移动硬盘，或 NTFS 格式移动硬盘 + NTFS For Mac软件来实现兼容。
详解如下：
首先，硬盘兼容问题是格式问题。有些品牌原装，比如你提到的希捷移动硬盘，号称是支持 Mac 和 Windows 双系统的，但那也是通e799bee5baa6e997aee7ad94e58685e5aeb9330过这款移动硬盘提供了的NTFS 的驱动，使得Mac可以使用 NTFS 的硬盘。
并且，安装完希捷提供的驱动后，就只能供希捷的硬盘使用，其他 NTFS 格式的存储设备会无法识别。
NTFS For Mac软件是专门解决Mac不兼容问题开发的软件，是首个支持Mac上读写NTFS外置存储设备解决方案，更加简单直观的在Mac机上随意对NTFS文件修改、删除等操作。在 Mac 上软件安装并重启后就能识别 NTFS 文件系统。
目前用 ExFAT 是最方便的，但是需要注意的是系统要求：Mac OS X 10.6.5+ 和 Windows XP Service Pack 2以上。另外，ExFAT 可能会不太稳定。
FAT32 虽然是兼容性好，但在实际运行中不支持单个文件大于 4GB 的文件，适合小容量 U 盘。
扩展资料：
NTFS For Mac软件其实它就相当一个媒介，使用它可以一键轻松搞定兼容问题，不仅可以读写修改文件还可以创建新档案和资料夹等。
目前最新版本是NTFS For Mac14，NTFS For Mac14完全兼容苹果新的安全政策，确保快速，轻松的和安全的访问NTFS分区。
同时又增添了很多实用方便的功能，比如挂载/卸载功能,格式(删除),验证和设置音量启动等等。
参考资料：
百度百科——NTFS
百度百科——ExFAT
百度百科——FAT32
windows系统只有win8可以通过windows to go功能安装在移动硬盘或优盘上使用，win7是不支持的。
本方法经过MacBook,MacBook Air实测，并可以互换使用 笔者使用硬盘：三星80GB老物+SSK移动硬盘盒 安装系统：Windows 7 Home Premium 安装环境：Mac OS X Lion，Windows 7 一，准备工具： 1.安装有Windows的电脑一台（Windows 8 不可）（或者准备安装有Windows PE的光盘或U盘） 这是用来安装新系统所需要用的环境，因为Windows 7 正常安装默认不能装进USB外置设备，所以要用特殊方法安装 (i)有现成Windows的同学可以直接用来安装新系统 (ii)没有的同学分两种 ①使用MacBook Air的同学，由于Air没有光驱，所以开机时按option，EFI是允许从直接从USB设备引导启动的， 所以请准备一张有Windows PE的U盘（不要把PE装在你要装外置系统的USB设备） ②使用其他MacBook,MacBook Pro的同学（其实iMac也可以- -只不过觉得没必要外置系统），这些机型都是有光驱的， 而且不支持USB设备引导启动 所以准备一张Windows PE启动光盘 2.在你的Mac系统中下载一个 rEFIt 的软件安装包（dmg）（不要安装，就放在那里）（运行环境是Mac OS，所以放在Mac OS里） rEFIt 相信对Mac OS有所研究的同学都知道，是用来在默认EFI启动选单下建立高级启动选单的一款插件 由于除了Air之外的MacBook都不支持直接从非Mac OS的USB设备直接引导启动 所以除了MacBook Air以外的都要利用这个插件来启动Windows 其实Air的用户是可以跳过这一步的，不过为了使你的外接硬盘变为万能盘，在哪台Mac上都能用，还是装一下比较好。 3.Windows 7 的iso安装镜像或光盘一份（在现成Windows或PE里使用，和现成Windows或PE放一起） 4.NT6快捷安装器（在现成Windows或PE里使用，和现成Windows或PE放一起） 这个就是用来破除Windows 7 在USB设备安装限制的安装工具 5.RegistryWorkshop高级注册编辑器（在现成Windows或PE里使用，和现成Windows或PE放一起） 用来在一个系统内修改另一个系统的注册表 6.BootCamp 4.0 驱动包 （随便放哪里留着就行） 安装完Windows 7之后在新系统里安装驱动，就和一般用BootCamp安装完系统后装驱动一样 7.用来安装Windows 7 的外置USB设备 硬盘容量必须在20GB以上，什么都玩并且想玩的爽的建议用80GB以上硬盘，速写速度当然越快越好 以上就是需要准备的工具 二，安装前准备以及检查，确保所有设备连接正常，该分区的分区，该格式化的格式化，该磁盘检查的磁盘检查，确保万无一失 关于硬盘的分区。分区请在Mac OS X的磁盘管理下进行!!!硬盘的话最好分三个区 第一个区用来安装rEFIt引导组件，分区大小128M就够了，分区格式Mac OS分区格式(HFS+) （只用Air的同学可以不装rEFIt，不分这个区） 第二个区用来安装Windows 7，在Mac OS X下先FAT格式分区，安装的时候再格NTFS。建议20GB以上。 第三个区用来存放你自己的文件和数据，剩余所有空间就行了，万一Windows坏了从重装第二个分区就行了，数据不会有事。 最后再检查一遍设备的连接性，确保没问题了我们就可以开始安装了。 三，将Windows 7 安装入USB硬盘 1.进入现成的Windows或者启动PE（工具1），插上你想要装Windows 7 的那个移动硬盘（工具7），然后以管理员身份运行NT6快捷安装器（工具4） 2.插入Windows 7 安装光盘，或者把iso用winRAR解压出来（工具3） 3.把你移动硬盘要装Windows 7 的那个分区（就是第二个分区，用Air的没有分rEFIt区的话应该是第一分区）格式化为NTFS格式，并标记为活动分区 活动分区的标记方法：右键我的电脑（Vista以上的话是计算机），“管理”-->"磁盘管理"，找到需要标那个分区，右键，“标记为活动分区”（重要） 4.看回到NT6快捷安装器，点右上角的“打开...”，找到你的Windows 7 安装光盘或者iso镜像解压出来文件夹下的“sources”文件夹里的“install.wim” 点确定。在左侧列表选择要装的版本。安装分区选择你那个移动硬盘要安装Windows 7 的分区（也就是刚刚格式化的那个分区）在当前 系统显示的盘符(一般来说不是C盘)，这步千万不能搞错...引导分区和刚才安装分区选同样的，同样不能搞错... 格式化由于刚刚已经做过了，可勾可不勾，你愿意的话也可以再格一次。 可选功能里面，“安装到USB移动硬盘”打勾（必须），更改系统占用盘符不勾 5.点击“开始安装”....等待....安装时间约10-20分钟....继续等..... 6.当显示安装成功之后，那Windows 7 的安装就基本完成了。先不要重启进入新系统。剩下的是一些后续处理和设置。 如果显示任何错误或失败信息那绝对是失败了，可以考虑换一个系统环境再安装。 四，后续处理和设置 1.在之前的Windows或PE里打开RegistryWorkshop高级注册编辑器（工具5） 2.“文件”-->“加载配置单元”，打开移动硬盘第二分区（用Air的没有分rEFIt区的话应该是第一分区）刚装完的那个新Windows 7 里的SYSTEM配置文件 路径是“[第二分区的盘符]:\Windows\System32\config\SYSTEM”(这个文件是没后缀的) 3.出现的窗口选择加载位置选择“HKEY_LOCAL_MACHINE” 4.然后在项名称这里随意键入喜欢的，比如“USB_WIN7” 5.在本系统的注册表的“HKEY_LOCAL_MACHINE”下就会多出一个“USB_WIN7”项（和刚刚改的名一样），这其实是连接到新安装的Windows 7 的项， 在此做的更改都会反映到新安装的Windows 7 6.打开以下键值“HKEY_LOCAL_MACHINE\USB_WIN7\ControlSet001\Control\BootDriverFlags”将数值更改为4（如果已经是4则不需要改动） 打开以下键值“HKEY_LOCAL_MACHINE\USB_WIN7\ControlSet001\Control\PnP\PollBootPartitionTimeout”将数值更改为十进制30000 7.鼠标点击一下刚刚加载到“HKEY_LOCAL_MACHINE”下的“USB_WIN7”项，将“USB_WIN7”项选中。然后点击菜单栏的“文件”-->“卸载配置单元” 至此，注册表的更改就大功告成了。 8.该关的东西关，该清理的清理。。之后就用不着现成的Windows和PE了 新安装的Windows 7 已经准备就绪，进入可用状态了，用Air的同学也已经可以直接插USB按option直接引导进系统了,可以选择直接跳到教程第六部分 五，安装rEFIt启动引导插件 1.进入Mac OS X，把下载的rEFIt的dmg包打开（工具2），不要用安装程序安装，需要手动安装。 2.把dmg包内的“efi”文件夹复制到移动硬盘之前分的那个只有128MB的分区格式为Mac OS格式用来装rEFIt的那个分区（也就是第一个区）的根目录 3.把移动硬盘的这个分区重命名为“refit”（不带引号） 4.运行“应用程序”-->“实用工具”-->“终端” 键入以下两条命令（不带引号） “cd /Volumes/refit/efi/refit” “./enable.sh” 可能会要求键e69da5e6ba90e799bee5baa6335入管理员密码，打密码回车就行。显示成功了就OK。 至此启动引导部分完成。关闭终端。移除硬盘并关机 六，进入Windows 7 安装BootCamp驱动 1.按电源键开机 2.立刻按住option 3.直到出现启动选单（用Air的同学已经能看到橘黄色的USB硬盘Windows了，直接选择进入就行，跳到第6步） 4.插入USB移动硬盘，稍等片刻会出现rEFIt的选项（不插硬盘不会出现，这就是手动安装rEFIt的好处，保证Mac的完美），选择打开 5.右边会出现两个带有USB符号的橘黄色硬盘标志，分别是从移动硬盘启动Windows和从移动硬盘第二分区启动，其实这两个是一样的- -，随便点 6.等待进入Windows... 7.各种重启各种等待后终于见到了桌面。Windows终于活过来了。 （这里有个小注意点，每次进Windows 7 都会说虚拟内存设置错误，这是因为系统 不支持把页面文件放在移动设备里，可以日后用软件禁用掉） 8.安装BootCamp 4.0驱动包（工具6），这个应该不用教了吧...能跟着这个蛋疼教程做下来的人应该不至于不会装个安装程序= = 9.重启，大功告成!!! 于是乎所有步骤完成!享受不会为Mac带来任何影响的Windows吧= =祝大家玩的愉快 最后有一个注意点：安装完的系统尽量不要更新，特别是非SP1版的Windows 7升级SP1后会 蓝屏 ，虽然笔者摸索出恢复过程，但恢复过程复杂 不建议尝试；还有就是各种驱动也少折腾- -蓝屏还是很麻烦的= = 之后有空了会更新一下使用USB硬盘Windows 7的一些注意点和心得，以及一些故障的排除。谢谢大家读完这么长的文章